Manuel Ortega nació con el nombre de pila Manuel Hanke, el 8 de abril de 1980 en Steyregg, en la región de la Alta Austria. Es hijo de padre austríaco (Peter Hanke) y madre española (Carmen Ortega Rangel), de ahí su nombre artístico españolizado. Cuando tenía 10 años comenzó su carrera como cantante, cantando con el Florianer Sängerknaben, uno de los coros infantiles más antiguos de toda Austria. A la edad de nueve años empezó a recibir clases de música con el profesor de canto Thomas Fleischanderl. Durante los siguientes cuatro años fue invitado en el coro Bruckner Linz, asistiendo hasta en dos ocasiones a una gala organizada por UNICEF y en la que recibió el Premio internacional Danny Kaye. Sus primeras apariciones en televisión fueron en Kinder Wurlitzer.

Su amor por la música pop lo llevó a unirse a una banda llamada BAFF cuando era un adolescente. Haber comenzado desde una edad tan temprana significó que Ortega fue capaz de hacer más de 200 interpretaciones para el 2003. Cuando tenía 17 años tomó parte en un concurso de búsqueda de talentos iniciado por Kronen Zeitung y fue escogido de entre 1.300 participantes para ser el cantante de un nuevo grupo. Aunque exitoso, el grupo no era suficiente para Manuel y, después de tres años, dos singles y un álbum, en 2001 comenzó su carrera en solitario. A los 20 años conoció al productor musical Alexander Kahr y firmó un contrato discográfico con EMI Music Austria. Su canción El amor, la vida fue la canción del verano por excelencia del 2001 en Austria.

En 2002, visto el éxito obtenido el pasado año, decidió presentarte al proceso de selección del representante austríaco para el Festival de Eurovision. Lo ganó con la canción Say a word y cantó en Tallin abanderando a su país, en donde obtuvo una 18ª posición.

Ese mismo año eurovisivo, Manuel sacó la canción Upside Down, que sirvió de cabecera para la serie Expedition Großglockner. En 2003 fue galardonado con el Amadeus Music Award y fue nominado a Single del año por su canción Say a word. Al año siguiente lanzó su segundo álbum en solitario, Love, Live, Fly; y cantó en el Baile de la Ópera de Nueva York. En 2006, Manuel participó en la segunda temporada del programa Dancing with stars, en el que bailó con la conocidísima bailarina de salón Kelly Kainz, con la que se proclamó vencedor. Debido a una apuesta que había hecho previamente, en la que prometía que si ganaba correría desnudo por el centro de la ciudad de Viena, Manuel tuvo que cumplir su promesa. Debido a sus éxitos, su ciudad natal le condecoró por méritos culturales y con el Premio de Danza de Viena.

También en 2006 se publicó el disco Angekommen, bajo el sello discográfico Sony Music Austria, entrando en el número 7 de las listas austríacas, y un disco recopilatorio de sus grandes éxitos, Best Of.  Estos lanzamientos fueron seguidos por una gira de conciertos por Austria. En 2008 fundó junto a Robert Brandstötter la Vienna Vocal Academy, en cooperación con el Conservatorio de Viena. Al año siguiente produjo los singles Only You y Heartbeat, con Cristiano Kolonovits. En julio de 2011 se casó con su novia Isabella Zellmann. Junto con algunos compañeros de toda la vida como Johannes Awa Kurz editó en 2012 su disco Niemals zu spät, del cual el primer sencillo fue Ohne Worte, entrando directamente a las listas de éxitos del país. Debido a su temperamento español y latino, Manuel Ortega es conocido como el Ricky Martin austríaco, aunque entre sus muchos talentos también se encuentra el de letrista y compositor de canciones.

Tras este álbum, sólo ha publicado cuatro nuevos singles: Genial («Genial») y Ich lieb dich (ist doch klar)  («Te amo (está muy claro)») en el 2013, I kumm («Vengo») (2018) y Er Fischt («Él pesca»)(2019), y Lentia (Linz) (2020). Los tres últimos singles están cantados en el dialecto alemán de la Alta Austria (Oberösterreichischer Dialekt). Lentia és cómo llaman a Linz, la capital del Land, en su dialecto, ciudad en la que viven sus padres y su hija.

Siempre ha compaginado su carrera musical con otras profesiones. Ha trabajado en una agencia de viajes (2 años), como personal de vuelo (3 años), y en el año 2001 creó su propia empresa de Espectáculos, justo un año antes de participar en Eurovisión, y estuvo diez años al frente de la misma, pero en el año 2011 tuvo que declararla en bancarrota. Empezó entonces a trabajar en una empresa de Tecnología, en la que estuvo diez años ejerciendo diferentes funciones, y en febrero de 2020 fundó una empresa de servicios profesionales, pero con la llegada de la pandemia, perdió gran parte de sus clientes, y la abandonó dos años después. Paralelamente, siguió trabajando como presentador desde 2018 hasta 2023 en la emisora de televisión privada WNTV (Wiener Neuestadt TV). Posteriormente, abrió una cafeteria/delicatessen en Viena.

Manuel continúa participando en diversos conciertos, tanto en su ciudad de origen, Linz, como en su ciudad de residencia, Viena, y siempre ha manifestado tener un gran recuerdo de su participación en Eurovisión.